El Observatorio está situado en el extremo meridional de la Comunidad Autónoma de Cantabria, en el término municipal de Rebollar de Ebro, perteneciente al Ayuntamiento de Valderredible. La longitud y latitud del lugar son: 3° 56' 36" W, 42° 46' 18" N, respectivamente, y la altitud es 1080 metros, siendo la población más cercana es Rocamundo.

La vía más fácil para llegar es por la autovía Santander-Palencia (A-67) ó por la nacional N-611, tomando la salida hacia Polientes (salida 122 de la autovía). Hay que seguir la CA-272 hasta Polientes y atravesar el pueblo. A unos doscientos metros después de salir de Polientes hay una desviación a la derecha que indica a Rocamundo (CA-757), hay que tomar esa desviación y seguir la carretera durante unos cinco kilómetros, atravesando Rocamundo. La carretera está asfaltada hasta el final, pero es una carretera de montaña con muchas curvas, así que hay que extremar las precauciones. El Observatorio se encuentra al final de la subida, cerca del mirador, pero se puede divisar ya desde media ladera.

También se puede llegar a Polientes desde la N-623, tomando la BU-613 y siguiendo el curso del río Ebro por la CA-275 y la CA-274 hasta encontrar la desviación a Rocamundo a la izquierda antes de llegar a Polientes.

(Ver mapa de la Vía Michelin centrada en Rocamundo).